投稿者: 管理人

2019.12.18追記
残念ながらいつの間にか併用はできなくなったようです。

2016.05.13追記
併用を解除する方法はつぎの通りです。
MMSだけにする場合は設定-一般-プロファイルからEメールを消すだけです。
Eメールにするのならば以下のauのメール設定から「メールアプリ(Eメール)でEZwebメールを利用する」を選ぶとMMSがこなくなります。

2015.09.29修正
2015.05.26追記
au以外では併用設定できません。
—

auのメール設定は気がつくと変更されててやり方が変わっているのでもう一度まとめてみます。

前提条件（iOS9で試した結果）
・Webメールを使う設定をしている
・パソコンでもメールをやり取りする設定をしたい
・iPhoneに「auサポート」アプリがインストールされている
・メールアドレスの変更（初期設定）は済んでいる

０、「設定」アプリで「Wi-Fi」がオフにする。

１、Safariで「auお客様サポート」ページを開き、少し下にある「iPhone設定ガイド」を選ぶ。

２、「iPhone設定ガイド」ページが出るので少し下の「iPhoneをもっと使いこなすための設定」にある「メールの設定を変更・確認したい」を選ぶ。

３、「Eメール設定画面へ」を押すとau IDの確認がでるので「ログイン」を押すと[auサポート]アプリでのログインチェックが行われ、エラーがなければ「メール設定」ページが出る。
（以前#5000に1234を送って出していた画面）

４-0、PCでもメールを確認したい場合には４-1から４-3を行う。
４-1、「メールアプリ(Eメール)でEZwebメールを利用する」の下にある青い文字の「手動設定」を押す。

４-2、「メール設定用のユーザ名/パスワードをSMSで送信します」ページが出るので青い文字の「設定情報送信」を押す。
メールの設定に必要な情報が表示されSMSでパスワードが届きます。

４-3、「メール設定用のユーザ名/パスワードをSMSで送信しました」ページが出るので一番下にある青い文字の「設定メニューに戻る」を押す。

５、「メール設定」ページに戻るので「メッセージアプリ(MMS)でEZwebメールを利用する」を選ぶ。

５-1、画面の指示通り「メッセージアプリ(MMS)利用設定」を押す。

５-2、「設定が完了しました」ページが出て、「設定アプリ」の注意点がでるので初めての人はよく確認すること。

５-3、このページの下の方に青い文字で「メールアプリ併用設定」があるので押す。

５-4、「設定用SMSを送信しました〜」ページが出るのでSafariを終る。

６、SMSを開きURLにアクセスすると「プロファイル」のインストールが出るのでインストールするとメールアプリの設定が終る。

これでメッセージアプリとメールアプリの両方にメールが届くようになります。通知も両方が鳴るのでどちらかは切った方が良いでしょう。
またメッセージアプリでメールを確認するとメールアプリの「未読」が消えるので気をつけましょう。

メッセージアプリにはメールのコピーが届きiPhone内に保存されています。削除してもメールアプリのメールは消えないので不要ならば両方消す必要があります。

Webメール画面やPCのメールアプリと併用する場合、どこかでメールを確認すると未読が消えます。これはメールがauのサーバ上にあるためで、１カ所で削除したら他の端末からも見えなくなりますので注意しましょう。